除去印石版始祖鸟的真正标本之外，还发现了许多石化的羽毛。1860年在索伦霍芬附近发现了首个羽毛化石，1861年对其进行描述。科学家们很是惊奇，因为该羽毛经历了漫长的时间，还保持着精确的细节。迄今为止，科学家们认为始祖鸟除了头部和脖子的上半部分外，全身都被羽毛覆盖。这也许是因为头部和脖子上的羽毛难以石化留存，也许是因为某些生理原因。
始祖鸟作为鸟类的祖先被广泛认可，它首先出现在侏罗纪。
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